Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm7093-201ENSMUST00000223004 581 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 AC156790.5-201ENSMUST00000227075 231 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Ttc21bQ0HA38 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms