Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm23781-201ENSMUST00000157940 308 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Vmn1r174-201ENSMUST00000167551 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Olfr603-201ENSMUST00000071844 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm7957-201ENSMUST00000207404 2602 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Sult6b1-204ENSMUST00000169544 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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