Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28698-201ENSMUST00000187734 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm29224-201ENSMUST00000187965 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm29189-201ENSMUST00000188018 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm29533-201ENSMUST00000190403 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm29030-201ENSMUST00000190848 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28742-201ENSMUST00000191001 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28899-201ENSMUST00000191161 615 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.8 ms