Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 AC154681.1-201ENSMUST00000225876 1735 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Hoxb9P20615 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.5 ms