Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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Ccl20O89093 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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Ccl20O89093 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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Ccl20O89093 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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Ccl20O89093 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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Ccl20O89093 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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Ccl20O89093 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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Ccl20O89093 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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Ccl20O89093 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
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Ccl20O89093 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC4.03□□□□□ -1.77
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