Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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Sp100O35892 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Sp100O35892 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Sp100O35892 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Sp100O35892 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Sp100O35892 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Sp100O35892 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Sp100O35892 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Sp100O35892 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sp100O35892 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sp100O35892 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Sp100O35892 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Sp100O35892 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms