Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Olfr367-ps-202ENSMUST00000143957 942 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms