Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms