Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23014-201ENSMUST00000104144 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7363-201ENSMUST00000119883 399 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6414-201ENSMUST00000183685 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms