Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm5538W4VSP6 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms