Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Rabgef1Q9JM13 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Rabgef1Q9JM13 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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Rabgef1Q9JM13 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Rabgef1Q9JM13 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Rabgef1Q9JM13 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Fbxw14-201ENSMUST00000112041 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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