Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm34716-201ENSMUST00000194060 621 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Bco1Q9JJS6 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.9 ms