Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp29Q9ES63 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms