Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc47Q9D024 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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