Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r174-201ENSMUST00000167551 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Cd180-201ENSMUST00000022124 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Glra3-201ENSMUST00000000275 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm23960-201ENSMUST00000157206 131 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm21742-201ENSMUST00000189352 548 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Rprd1bQ9CSU0 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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