Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg3Q9CPX6 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg3Q9CPX6 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg3Q9CPX6 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg3Q9CPX6 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg3Q9CPX6 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg3Q9CPX6 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg3Q9CPX6 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg3Q9CPX6 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg3Q9CPX6 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg3Q9CPX6 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg3Q9CPX6 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg3Q9CPX6 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg3Q9CPX6 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg3Q9CPX6 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg3Q9CPX6 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg3Q9CPX6 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg3Q9CPX6 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg3Q9CPX6 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg3Q9CPX6 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg3Q9CPX6 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg3Q9CPX6 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg3Q9CPX6 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Atg3Q9CPX6 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Atg3Q9CPX6 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms