Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Kdm5d-201ENSMUST00000055032 7974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms