Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Snx27Q3UHD6 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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Snx27Q3UHD6 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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Snx27Q3UHD6 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Snx27Q3UHD6 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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