Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm17106-201ENSMUST00000105610 459 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Trim71Q1PSW8 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm15933-201ENSMUST00000117215 616 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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