Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Cass4Q08EC4 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cass4Q08EC4 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Cass4Q08EC4 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Cass4Q08EC4 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.9 ms