Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 AC107453.2-201ENSMUST00000227714 655 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxd13P70217 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms