Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Sh3bp1P55194 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Sh3bp1P55194 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Sh3bp1P55194 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Sh3bp1P55194 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Sh3bp1P55194 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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Sh3bp1P55194 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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Sh3bp1P55194 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm2389-201ENSMUST00000160487 189 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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