Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm13166-203ENSMUST00000144166 326 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Mmp9P41245 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms