Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Syne1-205ENSMUST00000215295 27908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Pkhd1l1-203ENSMUST00000209244 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rpl28P41105 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rpl28P41105 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rpl28P41105 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rpl28P41105 Csmd3-201ENSMUST00000100670 13022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rpl28P41105 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rpl28P41105 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rpl28P41105 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rpl28P41105 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rpl28P41105 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rpl28P41105 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Rpl28P41105 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms