Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp4P35123 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp4P35123 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp4P35123 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp4P35123 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp4P35123 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Usp4P35123 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Usp4P35123 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms