Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm23014-201ENSMUST00000104144 130 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm23905-201ENSMUST00000157568 109 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms