Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ldb2O55203 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm25005-201ENSMUST00000083812 156 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ldb2O55203 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215.3 ms