Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Brpf1B2RRD7 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms