Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm45499-201ENSMUST00000211656 280 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Sult6b1-204ENSMUST00000169544 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm45539-201ENSMUST00000210313 428 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Col5a3Q9JLI2 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 4930528J11Rik-201ENSMUST00000201689 3611 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.7 ms