Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 n-R5s196-201ENSMUST00000083136 117 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc97Q9DBT3 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms