Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms