Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm38221-201ENSMUST00000195146 365 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 AC159472.1-201ENSMUST00000218178 463 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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RpainQ9CWY9 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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RpainQ9CWY9 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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