Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Gm11639-203ENSMUST00000212287 17665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Cpne9Q1RLL3 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms