Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Aspn-202ENSMUST00000177948 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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