Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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