Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Ggta1P23336 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms