Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pou5f1P20263 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms