Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
PtpraP18052 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
PtpraP18052 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms