Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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H2-Q1O19441 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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H2-Q1O19441 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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H2-Q1O19441 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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H2-Q1O19441 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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H2-Q1O19441 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
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H2-Q1O19441 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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H2-Q1O19441 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
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H2-Q1O19441 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-Q1O19441 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
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