Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rrn3B2RS91 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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