Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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