Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms