Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm26652-202ENSMUST00000181672 475 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Olfr347-201ENSMUST00000078761 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Hdac6Q9Z2V5 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Hdac6Q9Z2V5 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Hdac6Q9Z2V5 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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Hdac6Q9Z2V5 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hdac6Q9Z2V5 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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