Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms