Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Smg9Q9DB90 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms