Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16490-201ENSMUST00000165299 351 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7726-201ENSMUST00000206241 231 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms