Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc47Q9D024 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms