Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Usp16Q99LG0 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms