Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Olfr1109-201ENSMUST00000099863 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Hps4Q99KG7 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Hps4Q99KG7 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms