Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Ccdc88cQ6VGS5 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Ccdc88cQ6VGS5 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25821-201ENSMUST00000093657 133 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Ccdc88cQ6VGS5 AC149588.1-201ENSMUST00000228274 3745 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Apoo-ps-201ENSMUST00000061241 586 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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Ccdc88cQ6VGS5 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Ccdc88cQ6VGS5 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Ccdc88cQ6VGS5 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccdc88cQ6VGS5 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms